Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3Q8N9I9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX3Q8N9I9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms