Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTD1Q8N815 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTD1Q8N815 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTD1Q8N815 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTD1Q8N815 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms