Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF148Q8N7C7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF148Q8N7C7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF148Q8N7C7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF148Q8N7C7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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