Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC25Q8N386 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC25Q8N386 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC25Q8N386 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC25Q8N386 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms