Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FUNDC1Q8IVP5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FUNDC1Q8IVP5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FUNDC1Q8IVP5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FUNDC1Q8IVP5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FUNDC1Q8IVP5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FUNDC1Q8IVP5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FUNDC1Q8IVP5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms