Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDCD3Q8IVD9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDCD3Q8IVD9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDCD3Q8IVD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCD3Q8IVD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCD3Q8IVD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.9 ms