Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCF2L2Q86YR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCF2L2Q86YR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCF2L2Q86YR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCF2L2Q86YR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms