Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGMS1Q86VZ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGMS1Q86VZ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGMS1Q86VZ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGMS1Q86VZ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms