Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCA5Q86VQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCA5Q86VQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCA5Q86VQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCA5Q86VQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms