Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NPM2Q86SE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
NPM2Q86SE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NPM2Q86SE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NPM2Q86SE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NPM2Q86SE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms