Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A9Q7RTY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A9Q7RTY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC16A9Q7RTY1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC16A9Q7RTY1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms