Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTOP1Q7RTM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTOP1Q7RTM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTOP1Q7RTM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms