Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HS2ST1Q7LGA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HS2ST1Q7LGA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HS2ST1Q7LGA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms