Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK10Q6ZWH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK10Q6ZWH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK10Q6ZWH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK10Q6ZWH5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms