Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAXIP1Q6ZW49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PAXIP1Q6ZW49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAXIP1Q6ZW49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAXIP1Q6ZW49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms