Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYDE1Q6ZW31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYDE1Q6ZW31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE1Q6ZW31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms