Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KIAA1549LQ6ZVL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KIAA1549LQ6ZVL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms