Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC149Q6ZUS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC149Q6ZUS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC149Q6ZUS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC149Q6ZUS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms