Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SRCAPQ6ZRS2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SRCAPQ6ZRS2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SRCAPQ6ZRS2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SRCAPQ6ZRS2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms