Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNI2Q6ZMN8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNI2Q6ZMN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNI2Q6ZMN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNI2Q6ZMN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNI2Q6ZMN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms