Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPTNQ6XPR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPTNQ6XPR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPTNQ6XPR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPTNQ6XPR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms