Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TMIGD1Q6UXZ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMIGD1Q6UXZ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms