Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRSAM1Q6UWE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRSAM1Q6UWE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRSAM1Q6UWE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRSAM1Q6UWE0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2008.3 ms