Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN3Q6UW01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBLN3Q6UW01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms