Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
APOA5Q6Q788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOA5Q6Q788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOA5Q6Q788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOA5Q6Q788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms