Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASC4Q6P4E1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC4Q6P4E1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASC4Q6P4E1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC4Q6P4E1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms