Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF544Q6NX49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF544Q6NX49 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms