Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LHX8Q68G74 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LHX8Q68G74 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LHX8Q68G74 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LHX8Q68G74 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LHX8Q68G74 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LHX8Q68G74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LHX8Q68G74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHX8Q68G74 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LHX8Q68G74 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms