Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LPCAT4Q643R3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPCAT4Q643R3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPCAT4Q643R3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPCAT4Q643R3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms