Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM236Q5W0B7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM236Q5W0B7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM236Q5W0B7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM236Q5W0B7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms