Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF3Q5VWG9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF3Q5VWG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF3Q5VWG9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF3Q5VWG9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms