Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC1Q5TB30 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DEPDC1Q5TB30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DEPDC1Q5TB30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DEPDC1Q5TB30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms