Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY2Q5TAB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIPPLY2Q5TAB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPPLY2Q5TAB7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY2Q5TAB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY2Q5TAB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPPLY2Q5TAB7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPPLY2Q5TAB7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms