Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC18Q5T9S5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC18Q5T9S5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CCDC18Q5T9S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CCDC18Q5T9S5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CCDC18Q5T9S5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CCDC18Q5T9S5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms