Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIVEP3Q5T1R4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIVEP3Q5T1R4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms