Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HP1BP3Q5SSJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HP1BP3Q5SSJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HP1BP3Q5SSJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms