Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNAP47Q5SQN1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNAP47Q5SQN1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNAP47Q5SQN1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms