Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPIN3Q5JUX0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPIN3Q5JUX0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPIN3Q5JUX0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms