Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF628Q5EBL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF628Q5EBL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms