Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ53S08 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ53S08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB6CQ53S08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms