Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LONRF3Q496Y0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LONRF3Q496Y0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LONRF3Q496Y0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LONRF3Q496Y0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms