Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HKDC1Q2TB90 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HKDC1Q2TB90 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HKDC1Q2TB90 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HKDC1Q2TB90 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms