Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM44Q2T9K0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM44Q2T9K0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM44Q2T9K0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM44Q2T9K0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM44Q2T9K0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM44Q2T9K0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM44Q2T9K0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms