Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
DDB1Q16531 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
DDB1Q16531 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
DDB1Q16531 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDB1Q16531 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
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DDB1Q16531 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
DDB1Q16531 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
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