Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX1Q16384 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX1Q16384 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX1Q16384 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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