Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB11BQ15907 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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RAB11BQ15907 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB11BQ15907 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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