Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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VAMP3Q15836 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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VAMP3Q15836 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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VAMP3Q15836 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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VAMP3Q15836 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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VAMP3Q15836 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP3Q15836 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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