Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD1Q15797 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD1Q15797 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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