Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIBQ15653 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIBQ15653 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFKBIBQ15653 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NFKBIBQ15653 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms