Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNN3Q15417 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNN3Q15417 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN3Q15417 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN3Q15417 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNN3Q15417 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN3Q15417 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN3Q15417 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN3Q15417 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN3Q15417 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNN3Q15417 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN3Q15417 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNN3Q15417 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNN3Q15417 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNN3Q15417 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN3Q15417 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN3Q15417 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNN3Q15417 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNN3Q15417 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNN3Q15417 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN3Q15417 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN3Q15417 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN3Q15417 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN3Q15417 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN3Q15417 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN3Q15417 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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